| 1ª Classificatória | 2ª Classificatória | 3ª Classificatória | Play-off | Fase de Grupos | 2ª Fase |
| Oitavas-de-final | Quartas-de-final | Semifinal | Final |
Rodada:
Jogados
1ª Rodada
03/07/2012 - Terça
08:30
Shkëndija
0
x
0
Portadown
08:30
Víkingur Gota
0
x
6
Gomel
05/07/2012 - Quinta
08:00
Khazar
2
x
2
Nõmme Kalju
08:30
Jagodina
0
x
1
Ordabasy
08:30
KuPS
2
x
1
Llanelli
08:30
Narva Trans
0
x
5
Keşlə FK
08:30
Renova
4
x
0
Libertas
08:45
Levadia Tallinn
1
x
0
Šiauliai
09:00
Baku
0
x
0
Mura 05
09:00
Elfsborg
8
x
0
Floriana
09:00
JJK
2
x
0
Stabæk
09:00
Pyunik
0
x
3
Zeta
09:00
Rudar Pljevlja
0
x
1
Shirak
09:30
Dacia
1
x
0
Celje
09:30
Differdange 03
3
x
0
NSÍ Runavík
09:30
Sūduva
0
x
1
Daugava
10:00
Birkirkara
2
x
2
Metalurg Skopje
10:00
KF Tirana
2
x
0
Grevenmacher
10:00
Torpedo Kutaisi
1
x
1
Aktobe
10:30
Santa Coloma
0
x
1
Osijek
10:30
Sarajevo
5
x
2
Hibernians
10:45
Twente
6
x
0
UE Santa Coloma
11:00
EB/
3
x
1
Gandzasar
11:00
Lech Poznań
2
x
0
Zhetysu
11:00
Olimpija Ljubljana
3
x
0
Jeunesse Esch
11:15
MTK Budapest
1
x
1
Senica
11:30
Cefn Druids
0
x
0
MyPa
11:30
Flamurtari Vlorë
0
x
1
Honvéd
11:30
La Fiorita
0
x
2
Liepājas Metalurgs
11:30
Teuta Durrës
0
x
3
Rustavi Metalurgist