| 1ª Classificatória | 2ª Classificatória | 3ª Classificatória | Play-off | Fase de Grupos | 2ª Fase |
| Oitavas-de-final | Quartas-de-final | Semifinal | Final |
Rodada:
Jogados
1ª Rodada
05/07/2012 - Quinta
11:45
Bangor City
0
x
0
Zimbru Chişinău
11:45
Bohemians
0
x
0
Þór Akureyri
11:45
Cliftonville
1
x
0
Kalmar
11:45
St Patrick's Athletic
1
x
0
ÍBV Vestmannaeyjar
12:00
Crusaders
0
x
3
Rosenborg
12:05
Borac Banja Luka
2
x
2
Čelik Nikšić
12:15
FH
2
x
1
Eschen/
2ª Rodada
10/07/2012 - Terça
08:30
Floriana
0
x
4
Elfsborg
08:45
Grevenmacher
0
x
0
KF Tirana
08:45
Nõmme Kalju
0
x
2
Khazar
11:45
Portadown
2
x
1
Shkëndija
12/07/2012 - Quinta
05:00
Zhetysu
1
x
1
Lech Poznań
07:00
Ordabasy
0
x
0
Jagodina
07:00
Rustavi Metalurgist
6
x
1
Teuta Durrës
07:00
Shirak
1
x
1
Rudar Pljevlja
08:00
Aktobe
1
x
0
Torpedo Kutaisi
08:00
Gandzasar
2
x
0
EB/
08:00
Metalurg Skopje
0
x
0
Birkirkara
08:30
Čelik Nikšić
1
x
1
Borac Banja Luka
09:00
Daugava
2
x
3
Sūduva
09:00
Gomel
4
x
0
Víkingur Gota
09:00
Jeunesse Esch
0
x
3
Olimpija Ljubljana
09:00
Keşlə FK
2
x
0
Narva Trans
09:00
Liepājas Metalurgs
4
x
0
La Fiorita
09:00
Šiauliai
2
x
1
Levadia Tallinn
09:30
Zimbru Chişinău
2
x
1
Bangor City
10:00
Kalmar
4
x
0
Cliftonville
10:00
Rosenborg
1
x
0
Crusaders
10:00
Stabæk
3
x
2
JJK
10:30
Eschen/
0
x
1
FH