| 1ª Classificatória | 2ª Classificatória | 3ª Classificatória | Play-off | 1ª Fase | 2ª Fase |
| 3ª Fase | Quartas de final | Semifinais | Final |
Rodada:
Jogados
1ª Rodada
15/09/2016 - Quinta
19:05
Braga
1
x
1
Gent
19:05
Konyaspor
0
x
1
Shakhtar Donetsk
2ª Rodada
29/09/2016 - Quinta
17:00
Gent
2
x
0
Konyaspor
17:00
Shakhtar Donetsk
2
x
0
Braga
3ª Rodada
20/10/2016 - Quinta
17:00
Konyaspor
1
x
1
Braga
17:00
Shakhtar Donetsk
5
x
0
Gent
4ª Rodada
03/11/2016 - Quinta
20:05
Braga
3
x
1
Konyaspor
20:05
Gent
3
x
5
Shakhtar Donetsk
5ª Rodada
24/11/2016 - Quinta
18:00
Gent
2
x
2
Braga
18:00
Shakhtar Donetsk
4
x
0
Konyaspor
6ª Rodada
08/12/2016 - Quinta
16:00
Braga
2
x
4
Shakhtar Donetsk
16:00
Konyaspor
0
x
1
Gent